Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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