Protein–RNA interactions for Protein: Q15025

TNIP1, TNFAIP3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP1Q15025 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNIP1Q15025 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNIP1Q15025 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNIP1Q15025 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNIP1Q15025 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNIP1Q15025 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TNIP1Q15025 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TNIP1Q15025 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNIP1Q15025 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TNIP1Q15025 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNIP1Q15025 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNIP1Q15025 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNIP1Q15025 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNIP1Q15025 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNIP1Q15025 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNIP1Q15025 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNIP1Q15025 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNIP1Q15025 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNIP1Q15025 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNIP1Q15025 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TNIP1Q15025 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNIP1Q15025 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNIP1Q15025 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNIP1Q15025 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNIP1Q15025 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNIP1Q15025 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNIP1Q15025 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNIP1Q15025 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNIP1Q15025 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNIP1Q15025 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNIP1Q15025 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNIP1Q15025 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNIP1Q15025 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNIP1Q15025 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNIP1Q15025 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNIP1Q15025 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNIP1Q15025 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TNIP1Q15025 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TNIP1Q15025 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNIP1Q15025 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNIP1Q15025 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNIP1Q15025 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNIP1Q15025 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TNIP1Q15025 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNIP1Q15025 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNIP1Q15025 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNIP1Q15025 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TNIP1Q15025 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TNIP1Q15025 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TNIP1Q15025 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TNIP1Q15025 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNIP1Q15025 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNIP1Q15025 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNIP1Q15025 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNIP1Q15025 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNIP1Q15025 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNIP1Q15025 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNIP1Q15025 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TNIP1Q15025 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNIP1Q15025 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNIP1Q15025 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNIP1Q15025 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TNIP1Q15025 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNIP1Q15025 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNIP1Q15025 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNIP1Q15025 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNIP1Q15025 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNIP1Q15025 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNIP1Q15025 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNIP1Q15025 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNIP1Q15025 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNIP1Q15025 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNIP1Q15025 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TNIP1Q15025 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNIP1Q15025 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNIP1Q15025 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNIP1Q15025 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNIP1Q15025 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNIP1Q15025 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNIP1Q15025 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TNIP1Q15025 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNIP1Q15025 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNIP1Q15025 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TNIP1Q15025 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNIP1Q15025 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNIP1Q15025 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNIP1Q15025 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TNIP1Q15025 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNIP1Q15025 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNIP1Q15025 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNIP1Q15025 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNIP1Q15025 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TNIP1Q15025 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNIP1Q15025 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNIP1Q15025 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNIP1Q15025 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TNIP1Q15025 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNIP1Q15025 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNIP1Q15025 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNIP1Q15025 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms