Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPNMBQ14956 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPNMBQ14956 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GPNMBQ14956 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GPNMBQ14956 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GPNMBQ14956 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPNMBQ14956 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPNMBQ14956 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPNMBQ14956 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPNMBQ14956 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPNMBQ14956 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPNMBQ14956 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPNMBQ14956 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPNMBQ14956 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPNMBQ14956 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPNMBQ14956 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPNMBQ14956 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPNMBQ14956 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPNMBQ14956 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPNMBQ14956 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPNMBQ14956 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPNMBQ14956 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPNMBQ14956 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GPNMBQ14956 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPNMBQ14956 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPNMBQ14956 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPNMBQ14956 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPNMBQ14956 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPNMBQ14956 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPNMBQ14956 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GPNMBQ14956 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPNMBQ14956 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPNMBQ14956 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPNMBQ14956 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPNMBQ14956 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPNMBQ14956 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPNMBQ14956 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPNMBQ14956 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPNMBQ14956 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPNMBQ14956 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPNMBQ14956 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPNMBQ14956 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPNMBQ14956 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPNMBQ14956 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPNMBQ14956 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPNMBQ14956 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPNMBQ14956 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPNMBQ14956 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPNMBQ14956 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPNMBQ14956 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPNMBQ14956 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPNMBQ14956 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPNMBQ14956 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GPNMBQ14956 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPNMBQ14956 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPNMBQ14956 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPNMBQ14956 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPNMBQ14956 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPNMBQ14956 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPNMBQ14956 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GPNMBQ14956 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPNMBQ14956 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GPNMBQ14956 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPNMBQ14956 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPNMBQ14956 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPNMBQ14956 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GPNMBQ14956 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPNMBQ14956 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPNMBQ14956 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPNMBQ14956 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPNMBQ14956 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPNMBQ14956 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPNMBQ14956 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPNMBQ14956 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPNMBQ14956 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPNMBQ14956 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPNMBQ14956 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPNMBQ14956 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPNMBQ14956 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPNMBQ14956 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GPNMBQ14956 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPNMBQ14956 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPNMBQ14956 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPNMBQ14956 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPNMBQ14956 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPNMBQ14956 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPNMBQ14956 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPNMBQ14956 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPNMBQ14956 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPNMBQ14956 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPNMBQ14956 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPNMBQ14956 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPNMBQ14956 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPNMBQ14956 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPNMBQ14956 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GPNMBQ14956 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPNMBQ14956 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPNMBQ14956 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPNMBQ14956 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPNMBQ14956 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
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