Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CSHL1Q14406 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms