Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CACNA1CQ13936 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CACNA1CQ13936 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
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