Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC31.73■■■□□ 2.67
SHROOM2Q13796 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
SHROOM2Q13796 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
SHROOM2Q13796 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
SHROOM2Q13796 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
SHROOM2Q13796 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
SHROOM2Q13796 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
SHROOM2Q13796 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
SHROOM2Q13796 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
SHROOM2Q13796 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
SHROOM2Q13796 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
SHROOM2Q13796 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
SHROOM2Q13796 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
SHROOM2Q13796 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
SHROOM2Q13796 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
SHROOM2Q13796 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
SHROOM2Q13796 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
SHROOM2Q13796 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
SHROOM2Q13796 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
SHROOM2Q13796 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
SHROOM2Q13796 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
SHROOM2Q13796 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
SHROOM2Q13796 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
SHROOM2Q13796 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
SHROOM2Q13796 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
SHROOM2Q13796 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
SHROOM2Q13796 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
SHROOM2Q13796 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
SHROOM2Q13796 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
SHROOM2Q13796 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
SHROOM2Q13796 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
SHROOM2Q13796 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
SHROOM2Q13796 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
SHROOM2Q13796 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
SHROOM2Q13796 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
SHROOM2Q13796 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
SHROOM2Q13796 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
SHROOM2Q13796 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
SHROOM2Q13796 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
SHROOM2Q13796 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
SHROOM2Q13796 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
SHROOM2Q13796 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
SHROOM2Q13796 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
SHROOM2Q13796 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.66
SHROOM2Q13796 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.66
SHROOM2Q13796 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
SHROOM2Q13796 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
SHROOM2Q13796 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.66
SHROOM2Q13796 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.66
SHROOM2Q13796 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
SHROOM2Q13796 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
SHROOM2Q13796 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
SHROOM2Q13796 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
SHROOM2Q13796 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
SHROOM2Q13796 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
SHROOM2Q13796 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
SHROOM2Q13796 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
SHROOM2Q13796 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
SHROOM2Q13796 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
SHROOM2Q13796 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
SHROOM2Q13796 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC31.69■■■□□ 2.66
SHROOM2Q13796 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
SHROOM2Q13796 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
SHROOM2Q13796 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
SHROOM2Q13796 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
SHROOM2Q13796 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
SHROOM2Q13796 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC31.68■■■□□ 2.66
SHROOM2Q13796 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
SHROOM2Q13796 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
SHROOM2Q13796 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
SHROOM2Q13796 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
SHROOM2Q13796 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
SHROOM2Q13796 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
SHROOM2Q13796 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
SHROOM2Q13796 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
SHROOM2Q13796 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
SHROOM2Q13796 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
SHROOM2Q13796 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
SHROOM2Q13796 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
SHROOM2Q13796 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
SHROOM2Q13796 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
SHROOM2Q13796 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
SHROOM2Q13796 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
SHROOM2Q13796 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
SHROOM2Q13796 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
SHROOM2Q13796 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
SHROOM2Q13796 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
SHROOM2Q13796 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
SHROOM2Q13796 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
SHROOM2Q13796 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC31.66■■■□□ 2.66
SHROOM2Q13796 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
SHROOM2Q13796 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
SHROOM2Q13796 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
SHROOM2Q13796 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
SHROOM2Q13796 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
SHROOM2Q13796 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
SHROOM2Q13796 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
SHROOM2Q13796 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
SHROOM2Q13796 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
SHROOM2Q13796 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
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