Protein–RNA interactions for Protein: Q13753

LAMC2, Laminin subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC2Q13753 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMC2Q13753 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMC2Q13753 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMC2Q13753 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMC2Q13753 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMC2Q13753 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMC2Q13753 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMC2Q13753 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMC2Q13753 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMC2Q13753 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMC2Q13753 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMC2Q13753 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMC2Q13753 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMC2Q13753 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMC2Q13753 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMC2Q13753 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMC2Q13753 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMC2Q13753 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMC2Q13753 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMC2Q13753 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMC2Q13753 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMC2Q13753 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMC2Q13753 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMC2Q13753 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMC2Q13753 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMC2Q13753 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMC2Q13753 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMC2Q13753 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMC2Q13753 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMC2Q13753 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMC2Q13753 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMC2Q13753 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMC2Q13753 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMC2Q13753 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMC2Q13753 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMC2Q13753 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMC2Q13753 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMC2Q13753 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMC2Q13753 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMC2Q13753 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMC2Q13753 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMC2Q13753 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMC2Q13753 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMC2Q13753 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMC2Q13753 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LAMC2Q13753 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LAMC2Q13753 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LAMC2Q13753 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LAMC2Q13753 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LAMC2Q13753 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LAMC2Q13753 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LAMC2Q13753 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LAMC2Q13753 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LAMC2Q13753 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LAMC2Q13753 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LAMC2Q13753 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LAMC2Q13753 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LAMC2Q13753 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LAMC2Q13753 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LAMC2Q13753 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LAMC2Q13753 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMC2Q13753 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMC2Q13753 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMC2Q13753 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMC2Q13753 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMC2Q13753 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMC2Q13753 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMC2Q13753 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMC2Q13753 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMC2Q13753 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LAMC2Q13753 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMC2Q13753 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMC2Q13753 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMC2Q13753 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMC2Q13753 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMC2Q13753 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMC2Q13753 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMC2Q13753 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMC2Q13753 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMC2Q13753 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMC2Q13753 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMC2Q13753 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMC2Q13753 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMC2Q13753 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMC2Q13753 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMC2Q13753 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMC2Q13753 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LAMC2Q13753 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMC2Q13753 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMC2Q13753 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMC2Q13753 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMC2Q13753 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMC2Q13753 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMC2Q13753 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMC2Q13753 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMC2Q13753 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMC2Q13753 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMC2Q13753 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMC2Q13753 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LAMC2Q13753 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
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