Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TUBA3CQ13748 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TUBA3CQ13748 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
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