Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PEX6Q13608 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PEX6Q13608 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PEX6Q13608 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PEX6Q13608 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PEX6Q13608 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PEX6Q13608 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PEX6Q13608 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PEX6Q13608 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PEX6Q13608 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PEX6Q13608 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PEX6Q13608 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PEX6Q13608 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PEX6Q13608 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PEX6Q13608 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PEX6Q13608 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PEX6Q13608 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PEX6Q13608 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PEX6Q13608 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PEX6Q13608 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PEX6Q13608 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PEX6Q13608 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PEX6Q13608 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms