Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PRPF4BQ13523 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPF4BQ13523 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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