Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
XRCC4Q13426 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
XRCC4Q13426 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
XRCC4Q13426 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
XRCC4Q13426 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
XRCC4Q13426 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
XRCC4Q13426 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
XRCC4Q13426 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
XRCC4Q13426 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
XRCC4Q13426 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
XRCC4Q13426 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
XRCC4Q13426 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
XRCC4Q13426 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
XRCC4Q13426 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
XRCC4Q13426 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
XRCC4Q13426 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
XRCC4Q13426 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
XRCC4Q13426 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
XRCC4Q13426 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
XRCC4Q13426 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
XRCC4Q13426 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
XRCC4Q13426 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
XRCC4Q13426 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
XRCC4Q13426 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
XRCC4Q13426 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
XRCC4Q13426 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
XRCC4Q13426 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
XRCC4Q13426 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
XRCC4Q13426 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
XRCC4Q13426 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
XRCC4Q13426 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
XRCC4Q13426 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
XRCC4Q13426 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
XRCC4Q13426 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
XRCC4Q13426 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
XRCC4Q13426 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
XRCC4Q13426 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
XRCC4Q13426 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
XRCC4Q13426 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
XRCC4Q13426 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
XRCC4Q13426 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
XRCC4Q13426 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
XRCC4Q13426 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
XRCC4Q13426 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
XRCC4Q13426 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
XRCC4Q13426 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
XRCC4Q13426 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
XRCC4Q13426 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
XRCC4Q13426 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
XRCC4Q13426 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
XRCC4Q13426 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
XRCC4Q13426 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
XRCC4Q13426 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
XRCC4Q13426 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
XRCC4Q13426 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
XRCC4Q13426 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
XRCC4Q13426 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
XRCC4Q13426 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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