Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SRSF5Q13243 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SRSF5Q13243 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SRSF5Q13243 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SRSF5Q13243 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
SRSF5Q13243 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SRSF5Q13243 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SRSF5Q13243 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SRSF5Q13243 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SRSF5Q13243 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SRSF5Q13243 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
SRSF5Q13243 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SRSF5Q13243 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SRSF5Q13243 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SRSF5Q13243 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SRSF5Q13243 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SRSF5Q13243 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
SRSF5Q13243 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SRSF5Q13243 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SRSF5Q13243 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SRSF5Q13243 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SRSF5Q13243 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SRSF5Q13243 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SRSF5Q13243 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SRSF5Q13243 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SRSF5Q13243 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SRSF5Q13243 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SRSF5Q13243 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SRSF5Q13243 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SRSF5Q13243 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SRSF5Q13243 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SRSF5Q13243 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SRSF5Q13243 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SRSF5Q13243 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SRSF5Q13243 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SRSF5Q13243 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SRSF5Q13243 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SRSF5Q13243 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SRSF5Q13243 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SRSF5Q13243 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SRSF5Q13243 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SRSF5Q13243 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SRSF5Q13243 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SRSF5Q13243 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SRSF5Q13243 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SRSF5Q13243 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SRSF5Q13243 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SRSF5Q13243 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SRSF5Q13243 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SRSF5Q13243 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SRSF5Q13243 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SRSF5Q13243 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SRSF5Q13243 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SRSF5Q13243 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SRSF5Q13243 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SRSF5Q13243 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SRSF5Q13243 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SRSF5Q13243 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SRSF5Q13243 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SRSF5Q13243 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SRSF5Q13243 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SRSF5Q13243 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SRSF5Q13243 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SRSF5Q13243 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SRSF5Q13243 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SRSF5Q13243 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SRSF5Q13243 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SRSF5Q13243 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SRSF5Q13243 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SRSF5Q13243 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SRSF5Q13243 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SRSF5Q13243 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SRSF5Q13243 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SRSF5Q13243 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SRSF5Q13243 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SRSF5Q13243 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SRSF5Q13243 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SRSF5Q13243 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SRSF5Q13243 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SRSF5Q13243 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SRSF5Q13243 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SRSF5Q13243 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SRSF5Q13243 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SRSF5Q13243 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SRSF5Q13243 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SRSF5Q13243 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SRSF5Q13243 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SRSF5Q13243 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SRSF5Q13243 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SRSF5Q13243 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SRSF5Q13243 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SRSF5Q13243 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SRSF5Q13243 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SRSF5Q13243 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SRSF5Q13243 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SRSF5Q13243 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SRSF5Q13243 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SRSF5Q13243 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SRSF5Q13243 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SRSF5Q13243 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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