Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
CBX3Q13185 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CBX3Q13185 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
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