Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPA4Q13156 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms