Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
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