Protein–RNA interactions for Protein: Q13129

RLF, Zinc finger protein Rlf, humanhuman

Predictions only

Length 1,914 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLFQ13129 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RLFQ13129 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RLFQ13129 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RLFQ13129 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RLFQ13129 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RLFQ13129 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RLFQ13129 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RLFQ13129 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RLFQ13129 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RLFQ13129 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RLFQ13129 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RLFQ13129 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RLFQ13129 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RLFQ13129 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RLFQ13129 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RLFQ13129 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RLFQ13129 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RLFQ13129 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RLFQ13129 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RLFQ13129 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RLFQ13129 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RLFQ13129 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RLFQ13129 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RLFQ13129 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RLFQ13129 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RLFQ13129 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RLFQ13129 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RLFQ13129 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RLFQ13129 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RLFQ13129 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RLFQ13129 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RLFQ13129 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RLFQ13129 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RLFQ13129 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RLFQ13129 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RLFQ13129 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RLFQ13129 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RLFQ13129 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RLFQ13129 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RLFQ13129 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RLFQ13129 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RLFQ13129 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RLFQ13129 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RLFQ13129 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RLFQ13129 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RLFQ13129 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RLFQ13129 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RLFQ13129 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RLFQ13129 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RLFQ13129 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RLFQ13129 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RLFQ13129 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RLFQ13129 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RLFQ13129 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RLFQ13129 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RLFQ13129 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RLFQ13129 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RLFQ13129 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RLFQ13129 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RLFQ13129 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RLFQ13129 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RLFQ13129 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RLFQ13129 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RLFQ13129 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RLFQ13129 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RLFQ13129 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RLFQ13129 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RLFQ13129 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RLFQ13129 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RLFQ13129 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RLFQ13129 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RLFQ13129 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RLFQ13129 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RLFQ13129 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RLFQ13129 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RLFQ13129 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RLFQ13129 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RLFQ13129 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RLFQ13129 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RLFQ13129 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RLFQ13129 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RLFQ13129 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RLFQ13129 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RLFQ13129 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RLFQ13129 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RLFQ13129 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RLFQ13129 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RLFQ13129 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RLFQ13129 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RLFQ13129 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RLFQ13129 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RLFQ13129 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RLFQ13129 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RLFQ13129 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RLFQ13129 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RLFQ13129 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RLFQ13129 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RLFQ13129 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RLFQ13129 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RLFQ13129 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
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