Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
DUSP4Q13115 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DUSP4Q13115 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
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