Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAF1Q13077 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAF1Q13077 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAF1Q13077 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAF1Q13077 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAF1Q13077 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAF1Q13077 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAF1Q13077 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAF1Q13077 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAF1Q13077 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAF1Q13077 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAF1Q13077 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAF1Q13077 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAF1Q13077 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAF1Q13077 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAF1Q13077 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAF1Q13077 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAF1Q13077 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAF1Q13077 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAF1Q13077 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAF1Q13077 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAF1Q13077 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAF1Q13077 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAF1Q13077 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAF1Q13077 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAF1Q13077 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAF1Q13077 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAF1Q13077 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAF1Q13077 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAF1Q13077 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAF1Q13077 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAF1Q13077 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAF1Q13077 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAF1Q13077 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAF1Q13077 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAF1Q13077 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAF1Q13077 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAF1Q13077 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAF1Q13077 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAF1Q13077 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAF1Q13077 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAF1Q13077 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
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TRAF1Q13077 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRAF1Q13077 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
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TRAF1Q13077 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAF1Q13077 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAF1Q13077 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAF1Q13077 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAF1Q13077 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAF1Q13077 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRAF1Q13077 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
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TRAF1Q13077 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAF1Q13077 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAF1Q13077 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAF1Q13077 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAF1Q13077 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAF1Q13077 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAF1Q13077 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAF1Q13077 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAF1Q13077 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAF1Q13077 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAF1Q13077 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAF1Q13077 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAF1Q13077 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAF1Q13077 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAF1Q13077 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAF1Q13077 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAF1Q13077 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAF1Q13077 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAF1Q13077 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAF1Q13077 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAF1Q13077 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAF1Q13077 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
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