Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSTF3Q12996 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
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