Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NFX1Q12986 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NFX1Q12986 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NFX1Q12986 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NFX1Q12986 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NFX1Q12986 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NFX1Q12986 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NFX1Q12986 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NFX1Q12986 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NFX1Q12986 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NFX1Q12986 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NFX1Q12986 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NFX1Q12986 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NFX1Q12986 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NFX1Q12986 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NFX1Q12986 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NFX1Q12986 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NFX1Q12986 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NFX1Q12986 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NFX1Q12986 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NFX1Q12986 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NFX1Q12986 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NFX1Q12986 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NFX1Q12986 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NFX1Q12986 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NFX1Q12986 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NFX1Q12986 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NFX1Q12986 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NFX1Q12986 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NFX1Q12986 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NFX1Q12986 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NFX1Q12986 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NFX1Q12986 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NFX1Q12986 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NFX1Q12986 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NFX1Q12986 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NFX1Q12986 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NFX1Q12986 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NFX1Q12986 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NFX1Q12986 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NFX1Q12986 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NFX1Q12986 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NFX1Q12986 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NFX1Q12986 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NFX1Q12986 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NFX1Q12986 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NFX1Q12986 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NFX1Q12986 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NFX1Q12986 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NFX1Q12986 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NFX1Q12986 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NFX1Q12986 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NFX1Q12986 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NFX1Q12986 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NFX1Q12986 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NFX1Q12986 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NFX1Q12986 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NFX1Q12986 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NFX1Q12986 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NFX1Q12986 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NFX1Q12986 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NFX1Q12986 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NFX1Q12986 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NFX1Q12986 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NFX1Q12986 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NFX1Q12986 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NFX1Q12986 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NFX1Q12986 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NFX1Q12986 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NFX1Q12986 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NFX1Q12986 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NFX1Q12986 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NFX1Q12986 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NFX1Q12986 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NFX1Q12986 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NFX1Q12986 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NFX1Q12986 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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