Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
LMAN2Q12907 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMAN2Q12907 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMAN2Q12907 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMAN2Q12907 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMAN2Q12907 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMAN2Q12907 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMAN2Q12907 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMAN2Q12907 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMAN2Q12907 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMAN2Q12907 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMAN2Q12907 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMAN2Q12907 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMAN2Q12907 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMAN2Q12907 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMAN2Q12907 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMAN2Q12907 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
LMAN2Q12907 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMAN2Q12907 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMAN2Q12907 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMAN2Q12907 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMAN2Q12907 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMAN2Q12907 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMAN2Q12907 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LMAN2Q12907 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMAN2Q12907 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMAN2Q12907 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMAN2Q12907 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMAN2Q12907 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMAN2Q12907 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMAN2Q12907 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMAN2Q12907 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
LMAN2Q12907 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMAN2Q12907 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMAN2Q12907 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LMAN2Q12907 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
LMAN2Q12907 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
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