Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFIAQ12857 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFIAQ12857 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFIAQ12857 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFIAQ12857 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFIAQ12857 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFIAQ12857 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFIAQ12857 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NFIAQ12857 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NFIAQ12857 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NFIAQ12857 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NFIAQ12857 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NFIAQ12857 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NFIAQ12857 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NFIAQ12857 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NFIAQ12857 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NFIAQ12857 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NFIAQ12857 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NFIAQ12857 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NFIAQ12857 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NFIAQ12857 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NFIAQ12857 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NFIAQ12857 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NFIAQ12857 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NFIAQ12857 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NFIAQ12857 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NFIAQ12857 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NFIAQ12857 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFIAQ12857 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NFIAQ12857 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NFIAQ12857 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFIAQ12857 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFIAQ12857 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NFIAQ12857 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NFIAQ12857 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFIAQ12857 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFIAQ12857 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFIAQ12857 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFIAQ12857 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFIAQ12857 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFIAQ12857 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFIAQ12857 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFIAQ12857 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFIAQ12857 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFIAQ12857 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFIAQ12857 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFIAQ12857 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFIAQ12857 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NFIAQ12857 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NFIAQ12857 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NFIAQ12857 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NFIAQ12857 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NFIAQ12857 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NFIAQ12857 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NFIAQ12857 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NFIAQ12857 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NFIAQ12857 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NFIAQ12857 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NFIAQ12857 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NFIAQ12857 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NFIAQ12857 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NFIAQ12857 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NFIAQ12857 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NFIAQ12857 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NFIAQ12857 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NFIAQ12857 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NFIAQ12857 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NFIAQ12857 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NFIAQ12857 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NFIAQ12857 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NFIAQ12857 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NFIAQ12857 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NFIAQ12857 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NFIAQ12857 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NFIAQ12857 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NFIAQ12857 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NFIAQ12857 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NFIAQ12857 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NFIAQ12857 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NFIAQ12857 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NFIAQ12857 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NFIAQ12857 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NFIAQ12857 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NFIAQ12857 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NFIAQ12857 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NFIAQ12857 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NFIAQ12857 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NFIAQ12857 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NFIAQ12857 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NFIAQ12857 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NFIAQ12857 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NFIAQ12857 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NFIAQ12857 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NFIAQ12857 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NFIAQ12857 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NFIAQ12857 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NFIAQ12857 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NFIAQ12857 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NFIAQ12857 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NFIAQ12857 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms