Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NIPAL4Q0D2K0 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NIPAL4Q0D2K0 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms