Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
IFFO1Q0D2I5 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
IFFO1Q0D2I5 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
IFFO1Q0D2I5 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
IFFO1Q0D2I5 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
IFFO1Q0D2I5 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IFFO1Q0D2I5 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
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