Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
FAM27E3Q08E93 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
FAM27E3Q08E93 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms