Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PUDPQ08623 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms