Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
GOLGA3Q08378 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
GOLGA3Q08378 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
GOLGA3Q08378 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
GOLGA3Q08378 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
GOLGA3Q08378 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
GOLGA3Q08378 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
GOLGA3Q08378 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
GOLGA3Q08378 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
GOLGA3Q08378 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
GOLGA3Q08378 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
GOLGA3Q08378 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.74
GOLGA3Q08378 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
GOLGA3Q08378 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
GOLGA3Q08378 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
GOLGA3Q08378 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
GOLGA3Q08378 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
GOLGA3Q08378 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
GOLGA3Q08378 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
GOLGA3Q08378 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
GOLGA3Q08378 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
GOLGA3Q08378 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
GOLGA3Q08378 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
GOLGA3Q08378 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.18■■■□□ 2.74
GOLGA3Q08378 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
GOLGA3Q08378 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
GOLGA3Q08378 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
GOLGA3Q08378 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
GOLGA3Q08378 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
GOLGA3Q08378 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
GOLGA3Q08378 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
GOLGA3Q08378 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
GOLGA3Q08378 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
GOLGA3Q08378 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
GOLGA3Q08378 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
GOLGA3Q08378 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
GOLGA3Q08378 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
GOLGA3Q08378 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
GOLGA3Q08378 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
GOLGA3Q08378 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
GOLGA3Q08378 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
GOLGA3Q08378 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
GOLGA3Q08378 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
GOLGA3Q08378 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
GOLGA3Q08378 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
GOLGA3Q08378 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
GOLGA3Q08378 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
GOLGA3Q08378 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
GOLGA3Q08378 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
GOLGA3Q08378 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
GOLGA3Q08378 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
GOLGA3Q08378 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
GOLGA3Q08378 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
GOLGA3Q08378 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
GOLGA3Q08378 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
GOLGA3Q08378 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
GOLGA3Q08378 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
GOLGA3Q08378 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
GOLGA3Q08378 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
GOLGA3Q08378 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
GOLGA3Q08378 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
GOLGA3Q08378 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
GOLGA3Q08378 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
GOLGA3Q08378 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
GOLGA3Q08378 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
GOLGA3Q08378 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
GOLGA3Q08378 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
GOLGA3Q08378 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
GOLGA3Q08378 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
GOLGA3Q08378 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
GOLGA3Q08378 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
GOLGA3Q08378 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
GOLGA3Q08378 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
GOLGA3Q08378 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
GOLGA3Q08378 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
GOLGA3Q08378 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
GOLGA3Q08378 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
GOLGA3Q08378 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.73
GOLGA3Q08378 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.73
GOLGA3Q08378 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
GOLGA3Q08378 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
GOLGA3Q08378 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
GOLGA3Q08378 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
GOLGA3Q08378 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
GOLGA3Q08378 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
GOLGA3Q08378 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
GOLGA3Q08378 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
GOLGA3Q08378 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC32.13■■■□□ 2.73
GOLGA3Q08378 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
GOLGA3Q08378 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
GOLGA3Q08378 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
GOLGA3Q08378 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
GOLGA3Q08378 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
GOLGA3Q08378 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
GOLGA3Q08378 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
GOLGA3Q08378 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
GOLGA3Q08378 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
GOLGA3Q08378 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
GOLGA3Q08378 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
GOLGA3Q08378 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms