Protein–RNA interactions for Protein: Q08211

DHX9, ATP-dependent RNA helicase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX9Q08211 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DHX9Q08211 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DHX9Q08211 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DHX9Q08211 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DHX9Q08211 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DHX9Q08211 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DHX9Q08211 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DHX9Q08211 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DHX9Q08211 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DHX9Q08211 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DHX9Q08211 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DHX9Q08211 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DHX9Q08211 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DHX9Q08211 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DHX9Q08211 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DHX9Q08211 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DHX9Q08211 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DHX9Q08211 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DHX9Q08211 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
DHX9Q08211 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DHX9Q08211 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DHX9Q08211 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DHX9Q08211 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DHX9Q08211 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DHX9Q08211 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DHX9Q08211 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DHX9Q08211 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DHX9Q08211 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DHX9Q08211 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DHX9Q08211 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DHX9Q08211 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DHX9Q08211 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DHX9Q08211 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DHX9Q08211 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DHX9Q08211 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DHX9Q08211 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DHX9Q08211 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DHX9Q08211 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DHX9Q08211 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DHX9Q08211 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DHX9Q08211 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DHX9Q08211 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DHX9Q08211 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DHX9Q08211 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DHX9Q08211 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DHX9Q08211 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DHX9Q08211 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DHX9Q08211 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DHX9Q08211 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DHX9Q08211 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DHX9Q08211 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DHX9Q08211 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DHX9Q08211 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DHX9Q08211 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DHX9Q08211 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DHX9Q08211 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DHX9Q08211 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DHX9Q08211 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DHX9Q08211 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DHX9Q08211 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DHX9Q08211 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DHX9Q08211 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DHX9Q08211 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DHX9Q08211 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DHX9Q08211 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DHX9Q08211 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DHX9Q08211 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DHX9Q08211 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DHX9Q08211 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DHX9Q08211 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DHX9Q08211 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DHX9Q08211 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DHX9Q08211 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DHX9Q08211 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DHX9Q08211 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DHX9Q08211 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DHX9Q08211 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DHX9Q08211 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DHX9Q08211 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DHX9Q08211 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DHX9Q08211 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
DHX9Q08211 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DHX9Q08211 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DHX9Q08211 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DHX9Q08211 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DHX9Q08211 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DHX9Q08211 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DHX9Q08211 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DHX9Q08211 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DHX9Q08211 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DHX9Q08211 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DHX9Q08211 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DHX9Q08211 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DHX9Q08211 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DHX9Q08211 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DHX9Q08211 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DHX9Q08211 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DHX9Q08211 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DHX9Q08211 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DHX9Q08211 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms