Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TFF3Q07654 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TFF3Q07654 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms