Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EXOSC9Q06265 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EXOSC9Q06265 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EXOSC9Q06265 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EXOSC9Q06265 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
EXOSC9Q06265 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EXOSC9Q06265 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
EXOSC9Q06265 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
EXOSC9Q06265 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EXOSC9Q06265 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
EXOSC9Q06265 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
EXOSC9Q06265 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
EXOSC9Q06265 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
EXOSC9Q06265 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
EXOSC9Q06265 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
EXOSC9Q06265 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EXOSC9Q06265 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EXOSC9Q06265 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
EXOSC9Q06265 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
EXOSC9Q06265 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
EXOSC9Q06265 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EXOSC9Q06265 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EXOSC9Q06265 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EXOSC9Q06265 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
EXOSC9Q06265 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
EXOSC9Q06265 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EXOSC9Q06265 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
EXOSC9Q06265 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
EXOSC9Q06265 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EXOSC9Q06265 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EXOSC9Q06265 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
EXOSC9Q06265 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
EXOSC9Q06265 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EXOSC9Q06265 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
EXOSC9Q06265 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
EXOSC9Q06265 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
EXOSC9Q06265 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
EXOSC9Q06265 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EXOSC9Q06265 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
EXOSC9Q06265 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
EXOSC9Q06265 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EXOSC9Q06265 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
EXOSC9Q06265 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
EXOSC9Q06265 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
EXOSC9Q06265 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EXOSC9Q06265 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
EXOSC9Q06265 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
EXOSC9Q06265 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
EXOSC9Q06265 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
EXOSC9Q06265 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EXOSC9Q06265 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EXOSC9Q06265 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EXOSC9Q06265 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EXOSC9Q06265 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EXOSC9Q06265 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EXOSC9Q06265 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EXOSC9Q06265 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EXOSC9Q06265 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EXOSC9Q06265 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EXOSC9Q06265 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EXOSC9Q06265 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EXOSC9Q06265 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
EXOSC9Q06265 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EXOSC9Q06265 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EXOSC9Q06265 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EXOSC9Q06265 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
EXOSC9Q06265 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
EXOSC9Q06265 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EXOSC9Q06265 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EXOSC9Q06265 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EXOSC9Q06265 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EXOSC9Q06265 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EXOSC9Q06265 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EXOSC9Q06265 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EXOSC9Q06265 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EXOSC9Q06265 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EXOSC9Q06265 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EXOSC9Q06265 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
EXOSC9Q06265 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EXOSC9Q06265 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EXOSC9Q06265 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EXOSC9Q06265 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EXOSC9Q06265 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EXOSC9Q06265 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EXOSC9Q06265 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EXOSC9Q06265 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EXOSC9Q06265 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EXOSC9Q06265 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EXOSC9Q06265 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EXOSC9Q06265 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EXOSC9Q06265 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EXOSC9Q06265 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EXOSC9Q06265 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EXOSC9Q06265 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EXOSC9Q06265 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EXOSC9Q06265 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EXOSC9Q06265 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EXOSC9Q06265 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EXOSC9Q06265 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EXOSC9Q06265 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms