Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSBP1Q04837 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms