Protein–RNA interactions for Protein: Q04671

OCA2, P protein, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OCA2Q04671 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
OCA2Q04671 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms