Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CREMQ03060 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CREMQ03060 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CREMQ03060 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CREMQ03060 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CREMQ03060 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CREMQ03060 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CREMQ03060 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CREMQ03060 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CREMQ03060 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CREMQ03060 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CREMQ03060 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CREMQ03060 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CREMQ03060 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CREMQ03060 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CREMQ03060 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CREMQ03060 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CREMQ03060 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CREMQ03060 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CREMQ03060 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CREMQ03060 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CREMQ03060 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CREMQ03060 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CREMQ03060 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CREMQ03060 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CREMQ03060 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CREMQ03060 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CREMQ03060 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CREMQ03060 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CREMQ03060 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CREMQ03060 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CREMQ03060 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CREMQ03060 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CREMQ03060 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CREMQ03060 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CREMQ03060 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CREMQ03060 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CREMQ03060 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CREMQ03060 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CREMQ03060 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CREMQ03060 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CREMQ03060 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CREMQ03060 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CREMQ03060 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CREMQ03060 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CREMQ03060 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CREMQ03060 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CREMQ03060 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CREMQ03060 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CREMQ03060 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CREMQ03060 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CREMQ03060 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CREMQ03060 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CREMQ03060 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CREMQ03060 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CREMQ03060 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CREMQ03060 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CREMQ03060 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CREMQ03060 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CREMQ03060 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CREMQ03060 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CREMQ03060 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CREMQ03060 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CREMQ03060 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CREMQ03060 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CREMQ03060 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CREMQ03060 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CREMQ03060 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CREMQ03060 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CREMQ03060 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CREMQ03060 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CREMQ03060 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CREMQ03060 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CREMQ03060 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CREMQ03060 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CREMQ03060 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CREMQ03060 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CREMQ03060 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CREMQ03060 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CREMQ03060 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CREMQ03060 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CREMQ03060 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CREMQ03060 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CREMQ03060 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CREMQ03060 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CREMQ03060 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CREMQ03060 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CREMQ03060 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CREMQ03060 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CREMQ03060 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CREMQ03060 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CREMQ03060 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CREMQ03060 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CREMQ03060 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CREMQ03060 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CREMQ03060 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CREMQ03060 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CREMQ03060 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CREMQ03060 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CREMQ03060 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms