Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTN2Q02246 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CNTN2Q02246 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTN2Q02246 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTN2Q02246 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTN2Q02246 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTN2Q02246 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTN2Q02246 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTN2Q02246 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTN2Q02246 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTN2Q02246 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTN2Q02246 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTN2Q02246 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTN2Q02246 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTN2Q02246 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTN2Q02246 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTN2Q02246 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTN2Q02246 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTN2Q02246 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTN2Q02246 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTN2Q02246 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTN2Q02246 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTN2Q02246 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTN2Q02246 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTN2Q02246 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTN2Q02246 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTN2Q02246 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTN2Q02246 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTN2Q02246 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTN2Q02246 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTN2Q02246 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTN2Q02246 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTN2Q02246 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTN2Q02246 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTN2Q02246 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTN2Q02246 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTN2Q02246 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTN2Q02246 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTN2Q02246 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTN2Q02246 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTN2Q02246 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTN2Q02246 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTN2Q02246 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTN2Q02246 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTN2Q02246 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTN2Q02246 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTN2Q02246 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTN2Q02246 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTN2Q02246 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTN2Q02246 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTN2Q02246 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTN2Q02246 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTN2Q02246 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTN2Q02246 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTN2Q02246 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTN2Q02246 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTN2Q02246 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTN2Q02246 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTN2Q02246 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTN2Q02246 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTN2Q02246 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTN2Q02246 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTN2Q02246 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTN2Q02246 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTN2Q02246 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTN2Q02246 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTN2Q02246 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTN2Q02246 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTN2Q02246 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTN2Q02246 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTN2Q02246 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTN2Q02246 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTN2Q02246 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTN2Q02246 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTN2Q02246 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTN2Q02246 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTN2Q02246 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTN2Q02246 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTN2Q02246 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTN2Q02246 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTN2Q02246 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTN2Q02246 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTN2Q02246 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTN2Q02246 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTN2Q02246 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTN2Q02246 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTN2Q02246 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTN2Q02246 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTN2Q02246 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTN2Q02246 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTN2Q02246 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTN2Q02246 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTN2Q02246 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTN2Q02246 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTN2Q02246 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTN2Q02246 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTN2Q02246 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTN2Q02246 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTN2Q02246 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTN2Q02246 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.1 ms