Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PLCB3Q01970 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms