Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
XPCQ01831 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
XPCQ01831 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
XPCQ01831 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
XPCQ01831 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
XPCQ01831 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
XPCQ01831 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
XPCQ01831 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
XPCQ01831 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
XPCQ01831 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
XPCQ01831 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
XPCQ01831 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
XPCQ01831 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
XPCQ01831 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
XPCQ01831 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
XPCQ01831 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
XPCQ01831 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
XPCQ01831 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
XPCQ01831 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
XPCQ01831 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
XPCQ01831 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
XPCQ01831 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
XPCQ01831 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
XPCQ01831 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
XPCQ01831 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
XPCQ01831 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
XPCQ01831 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
XPCQ01831 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
XPCQ01831 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
XPCQ01831 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
XPCQ01831 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
XPCQ01831 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
XPCQ01831 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
XPCQ01831 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
XPCQ01831 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
XPCQ01831 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
XPCQ01831 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
XPCQ01831 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
XPCQ01831 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
XPCQ01831 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
XPCQ01831 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
XPCQ01831 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
XPCQ01831 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
XPCQ01831 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
XPCQ01831 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
XPCQ01831 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
XPCQ01831 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
XPCQ01831 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
XPCQ01831 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
XPCQ01831 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
XPCQ01831 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
XPCQ01831 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
XPCQ01831 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
XPCQ01831 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
XPCQ01831 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
XPCQ01831 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
XPCQ01831 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
XPCQ01831 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
XPCQ01831 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
XPCQ01831 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
XPCQ01831 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
XPCQ01831 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
XPCQ01831 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
XPCQ01831 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
XPCQ01831 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
XPCQ01831 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
XPCQ01831 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
XPCQ01831 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
XPCQ01831 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
XPCQ01831 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
XPCQ01831 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
XPCQ01831 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
XPCQ01831 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
XPCQ01831 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
XPCQ01831 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
XPCQ01831 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
XPCQ01831 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
XPCQ01831 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
XPCQ01831 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
XPCQ01831 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
XPCQ01831 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
XPCQ01831 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
XPCQ01831 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
XPCQ01831 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
XPCQ01831 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
XPCQ01831 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
XPCQ01831 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
XPCQ01831 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
XPCQ01831 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
XPCQ01831 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
XPCQ01831 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
XPCQ01831 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
XPCQ01831 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
XPCQ01831 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
XPCQ01831 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
XPCQ01831 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
XPCQ01831 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
XPCQ01831 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
XPCQ01831 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
XPCQ01831 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms