Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MS4A2Q01362 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
MS4A2Q01362 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MS4A2Q01362 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MS4A2Q01362 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MS4A2Q01362 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MS4A2Q01362 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MS4A2Q01362 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MS4A2Q01362 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MS4A2Q01362 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MS4A2Q01362 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
MS4A2Q01362 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MS4A2Q01362 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MS4A2Q01362 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
MS4A2Q01362 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
MS4A2Q01362 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MS4A2Q01362 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MS4A2Q01362 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MS4A2Q01362 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MS4A2Q01362 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MS4A2Q01362 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MS4A2Q01362 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MS4A2Q01362 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MS4A2Q01362 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MS4A2Q01362 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MS4A2Q01362 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MS4A2Q01362 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MS4A2Q01362 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MS4A2Q01362 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MS4A2Q01362 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MS4A2Q01362 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MS4A2Q01362 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MS4A2Q01362 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MS4A2Q01362 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MS4A2Q01362 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
MS4A2Q01362 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MS4A2Q01362 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MS4A2Q01362 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MS4A2Q01362 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MS4A2Q01362 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MS4A2Q01362 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
MS4A2Q01362 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MS4A2Q01362 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MS4A2Q01362 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MS4A2Q01362 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MS4A2Q01362 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MS4A2Q01362 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MS4A2Q01362 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MS4A2Q01362 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MS4A2Q01362 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MS4A2Q01362 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MS4A2Q01362 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MS4A2Q01362 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MS4A2Q01362 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
MS4A2Q01362 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MS4A2Q01362 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MS4A2Q01362 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
MS4A2Q01362 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MS4A2Q01362 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MS4A2Q01362 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MS4A2Q01362 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MS4A2Q01362 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
MS4A2Q01362 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MS4A2Q01362 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MS4A2Q01362 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MS4A2Q01362 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MS4A2Q01362 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MS4A2Q01362 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MS4A2Q01362 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MS4A2Q01362 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MS4A2Q01362 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MS4A2Q01362 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MS4A2Q01362 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MS4A2Q01362 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.6 ms