Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN7AQ01118 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SCN7AQ01118 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCN7AQ01118 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCN7AQ01118 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCN7AQ01118 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCN7AQ01118 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCN7AQ01118 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCN7AQ01118 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCN7AQ01118 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SCN7AQ01118 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCN7AQ01118 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SCN7AQ01118 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCN7AQ01118 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCN7AQ01118 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCN7AQ01118 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCN7AQ01118 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCN7AQ01118 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCN7AQ01118 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCN7AQ01118 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCN7AQ01118 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCN7AQ01118 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCN7AQ01118 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCN7AQ01118 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCN7AQ01118 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCN7AQ01118 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCN7AQ01118 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCN7AQ01118 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCN7AQ01118 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCN7AQ01118 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCN7AQ01118 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCN7AQ01118 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SCN7AQ01118 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCN7AQ01118 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SCN7AQ01118 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCN7AQ01118 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SCN7AQ01118 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SCN7AQ01118 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCN7AQ01118 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCN7AQ01118 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCN7AQ01118 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCN7AQ01118 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SCN7AQ01118 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCN7AQ01118 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCN7AQ01118 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCN7AQ01118 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCN7AQ01118 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCN7AQ01118 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCN7AQ01118 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCN7AQ01118 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCN7AQ01118 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SCN7AQ01118 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCN7AQ01118 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCN7AQ01118 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCN7AQ01118 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCN7AQ01118 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCN7AQ01118 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SCN7AQ01118 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCN7AQ01118 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCN7AQ01118 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCN7AQ01118 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCN7AQ01118 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCN7AQ01118 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCN7AQ01118 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCN7AQ01118 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCN7AQ01118 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCN7AQ01118 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCN7AQ01118 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCN7AQ01118 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCN7AQ01118 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCN7AQ01118 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCN7AQ01118 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCN7AQ01118 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCN7AQ01118 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCN7AQ01118 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCN7AQ01118 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCN7AQ01118 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCN7AQ01118 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCN7AQ01118 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCN7AQ01118 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCN7AQ01118 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCN7AQ01118 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCN7AQ01118 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCN7AQ01118 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SCN7AQ01118 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SCN7AQ01118 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCN7AQ01118 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCN7AQ01118 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCN7AQ01118 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCN7AQ01118 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCN7AQ01118 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCN7AQ01118 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCN7AQ01118 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SCN7AQ01118 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SCN7AQ01118 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCN7AQ01118 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SCN7AQ01118 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCN7AQ01118 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCN7AQ01118 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCN7AQ01118 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms