Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FGD1P98174 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FGD1P98174 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FGD1P98174 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FGD1P98174 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
FGD1P98174 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
FGD1P98174 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FGD1P98174 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
FGD1P98174 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
FGD1P98174 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
FGD1P98174 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FGD1P98174 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FGD1P98174 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FGD1P98174 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FGD1P98174 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FGD1P98174 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FGD1P98174 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FGD1P98174 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FGD1P98174 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FGD1P98174 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FGD1P98174 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FGD1P98174 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FGD1P98174 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FGD1P98174 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FGD1P98174 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FGD1P98174 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FGD1P98174 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FGD1P98174 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FGD1P98174 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FGD1P98174 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
FGD1P98174 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FGD1P98174 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FGD1P98174 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FGD1P98174 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FGD1P98174 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FGD1P98174 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FGD1P98174 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FGD1P98174 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FGD1P98174 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FGD1P98174 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FGD1P98174 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FGD1P98174 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FGD1P98174 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FGD1P98174 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
FGD1P98174 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FGD1P98174 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FGD1P98174 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FGD1P98174 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FGD1P98174 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FGD1P98174 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FGD1P98174 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FGD1P98174 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FGD1P98174 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FGD1P98174 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FGD1P98174 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FGD1P98174 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FGD1P98174 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FGD1P98174 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FGD1P98174 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FGD1P98174 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
FGD1P98174 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FGD1P98174 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FGD1P98174 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FGD1P98174 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FGD1P98174 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
FGD1P98174 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
FGD1P98174 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FGD1P98174 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FGD1P98174 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FGD1P98174 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FGD1P98174 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FGD1P98174 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FGD1P98174 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FGD1P98174 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FGD1P98174 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FGD1P98174 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FGD1P98174 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FGD1P98174 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FGD1P98174 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FGD1P98174 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FGD1P98174 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FGD1P98174 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FGD1P98174 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FGD1P98174 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FGD1P98174 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FGD1P98174 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FGD1P98174 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FGD1P98174 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FGD1P98174 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FGD1P98174 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FGD1P98174 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FGD1P98174 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FGD1P98174 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
FGD1P98174 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FGD1P98174 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FGD1P98174 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FGD1P98174 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FGD1P98174 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FGD1P98174 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FGD1P98174 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms