Protein–RNA interactions for Protein: P62888

RPL30, 60S ribosomal protein L30, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL30P62888 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL30P62888 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RPL30P62888 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPL30P62888 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPL30P62888 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPL30P62888 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPL30P62888 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RPL30P62888 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPL30P62888 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPL30P62888 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPL30P62888 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RPL30P62888 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RPL30P62888 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPL30P62888 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPL30P62888 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPL30P62888 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPL30P62888 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPL30P62888 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPL30P62888 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RPL30P62888 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPL30P62888 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RPL30P62888 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RPL30P62888 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL30P62888 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL30P62888 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL30P62888 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL30P62888 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL30P62888 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL30P62888 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL30P62888 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL30P62888 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL30P62888 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL30P62888 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL30P62888 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL30P62888 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL30P62888 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL30P62888 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL30P62888 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL30P62888 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL30P62888 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL30P62888 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL30P62888 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL30P62888 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL30P62888 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL30P62888 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL30P62888 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL30P62888 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL30P62888 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL30P62888 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL30P62888 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL30P62888 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL30P62888 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL30P62888 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL30P62888 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL30P62888 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL30P62888 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL30P62888 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL30P62888 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL30P62888 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL30P62888 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL30P62888 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL30P62888 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL30P62888 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL30P62888 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL30P62888 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL30P62888 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL30P62888 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL30P62888 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL30P62888 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL30P62888 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL30P62888 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL30P62888 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL30P62888 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL30P62888 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL30P62888 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL30P62888 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL30P62888 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL30P62888 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL30P62888 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL30P62888 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL30P62888 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL30P62888 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL30P62888 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL30P62888 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL30P62888 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL30P62888 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL30P62888 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL30P62888 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL30P62888 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL30P62888 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL30P62888 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL30P62888 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL30P62888 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL30P62888 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL30P62888 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL30P62888 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL30P62888 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL30P62888 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL30P62888 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL30P62888 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms