Protein–RNA interactions for Protein: P62745

RHOB, Rho-related GTP-binding protein RhoB, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBP62745 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOBP62745 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOBP62745 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOBP62745 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOBP62745 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOBP62745 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOBP62745 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOBP62745 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOBP62745 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOBP62745 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOBP62745 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOBP62745 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOBP62745 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOBP62745 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOBP62745 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOBP62745 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOBP62745 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOBP62745 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOBP62745 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOBP62745 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOBP62745 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOBP62745 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOBP62745 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOBP62745 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOBP62745 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOBP62745 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOBP62745 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOBP62745 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOBP62745 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOBP62745 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOBP62745 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RHOBP62745 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOBP62745 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOBP62745 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOBP62745 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOBP62745 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOBP62745 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOBP62745 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOBP62745 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOBP62745 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOBP62745 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOBP62745 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOBP62745 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOBP62745 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOBP62745 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOBP62745 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOBP62745 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOBP62745 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOBP62745 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOBP62745 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOBP62745 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOBP62745 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOBP62745 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOBP62745 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOBP62745 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOBP62745 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOBP62745 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOBP62745 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOBP62745 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOBP62745 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOBP62745 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOBP62745 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOBP62745 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOBP62745 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOBP62745 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOBP62745 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOBP62745 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RHOBP62745 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RHOBP62745 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RHOBP62745 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RHOBP62745 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHOBP62745 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHOBP62745 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHOBP62745 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHOBP62745 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHOBP62745 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHOBP62745 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHOBP62745 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RHOBP62745 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHOBP62745 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHOBP62745 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHOBP62745 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHOBP62745 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHOBP62745 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHOBP62745 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHOBP62745 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHOBP62745 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHOBP62745 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHOBP62745 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHOBP62745 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHOBP62745 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHOBP62745 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RHOBP62745 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOBP62745 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOBP62745 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOBP62745 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOBP62745 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOBP62745 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOBP62745 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RHOBP62745 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms