Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LMO4P61968 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LMO4P61968 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LMO4P61968 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LMO4P61968 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LMO4P61968 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LMO4P61968 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LMO4P61968 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LMO4P61968 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LMO4P61968 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LMO4P61968 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LMO4P61968 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LMO4P61968 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LMO4P61968 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LMO4P61968 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LMO4P61968 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LMO4P61968 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LMO4P61968 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LMO4P61968 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LMO4P61968 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LMO4P61968 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LMO4P61968 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LMO4P61968 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LMO4P61968 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LMO4P61968 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LMO4P61968 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
LMO4P61968 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LMO4P61968 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
LMO4P61968 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LMO4P61968 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
LMO4P61968 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
LMO4P61968 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LMO4P61968 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LMO4P61968 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LMO4P61968 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LMO4P61968 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LMO4P61968 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LMO4P61968 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LMO4P61968 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LMO4P61968 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LMO4P61968 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
LMO4P61968 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LMO4P61968 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LMO4P61968 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LMO4P61968 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LMO4P61968 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
LMO4P61968 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LMO4P61968 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LMO4P61968 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
LMO4P61968 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LMO4P61968 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LMO4P61968 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LMO4P61968 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LMO4P61968 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LMO4P61968 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LMO4P61968 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LMO4P61968 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LMO4P61968 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LMO4P61968 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LMO4P61968 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LMO4P61968 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LMO4P61968 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LMO4P61968 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LMO4P61968 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LMO4P61968 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LMO4P61968 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LMO4P61968 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LMO4P61968 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LMO4P61968 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LMO4P61968 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LMO4P61968 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LMO4P61968 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LMO4P61968 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LMO4P61968 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LMO4P61968 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LMO4P61968 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LMO4P61968 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LMO4P61968 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LMO4P61968 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LMO4P61968 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LMO4P61968 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LMO4P61968 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LMO4P61968 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LMO4P61968 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LMO4P61968 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LMO4P61968 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LMO4P61968 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LMO4P61968 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LMO4P61968 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LMO4P61968 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LMO4P61968 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LMO4P61968 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LMO4P61968 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LMO4P61968 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LMO4P61968 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LMO4P61968 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LMO4P61968 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LMO4P61968 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LMO4P61968 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LMO4P61968 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms