Protein–RNA interactions for Protein: P59797

SELENOV, Selenoprotein V, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOVP59797 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SELENOVP59797 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SELENOVP59797 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SELENOVP59797 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SELENOVP59797 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SELENOVP59797 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SELENOVP59797 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SELENOVP59797 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SELENOVP59797 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SELENOVP59797 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SELENOVP59797 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SELENOVP59797 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SELENOVP59797 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SELENOVP59797 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SELENOVP59797 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SELENOVP59797 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SELENOVP59797 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SELENOVP59797 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SELENOVP59797 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SELENOVP59797 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SELENOVP59797 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SELENOVP59797 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SELENOVP59797 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SELENOVP59797 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SELENOVP59797 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SELENOVP59797 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SELENOVP59797 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SELENOVP59797 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SELENOVP59797 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SELENOVP59797 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SELENOVP59797 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SELENOVP59797 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SELENOVP59797 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SELENOVP59797 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SELENOVP59797 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SELENOVP59797 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SELENOVP59797 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SELENOVP59797 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SELENOVP59797 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SELENOVP59797 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SELENOVP59797 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SELENOVP59797 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SELENOVP59797 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SELENOVP59797 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SELENOVP59797 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SELENOVP59797 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SELENOVP59797 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SELENOVP59797 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SELENOVP59797 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SELENOVP59797 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SELENOVP59797 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SELENOVP59797 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SELENOVP59797 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SELENOVP59797 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SELENOVP59797 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SELENOVP59797 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SELENOVP59797 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SELENOVP59797 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SELENOVP59797 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SELENOVP59797 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SELENOVP59797 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SELENOVP59797 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SELENOVP59797 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SELENOVP59797 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SELENOVP59797 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SELENOVP59797 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SELENOVP59797 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SELENOVP59797 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SELENOVP59797 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SELENOVP59797 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SELENOVP59797 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SELENOVP59797 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SELENOVP59797 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SELENOVP59797 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SELENOVP59797 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SELENOVP59797 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SELENOVP59797 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SELENOVP59797 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SELENOVP59797 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SELENOVP59797 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SELENOVP59797 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SELENOVP59797 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SELENOVP59797 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SELENOVP59797 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SELENOVP59797 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SELENOVP59797 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SELENOVP59797 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SELENOVP59797 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SELENOVP59797 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SELENOVP59797 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SELENOVP59797 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SELENOVP59797 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SELENOVP59797 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SELENOVP59797 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SELENOVP59797 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SELENOVP59797 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SELENOVP59797 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SELENOVP59797 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SELENOVP59797 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SELENOVP59797 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms