Protein–RNA interactions for Protein: P57055

RIPPLY3, Protein ripply3, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY3P57055 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIPPLY3P57055 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIPPLY3P57055 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIPPLY3P57055 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIPPLY3P57055 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIPPLY3P57055 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIPPLY3P57055 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIPPLY3P57055 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIPPLY3P57055 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIPPLY3P57055 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RIPPLY3P57055 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIPPLY3P57055 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIPPLY3P57055 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIPPLY3P57055 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIPPLY3P57055 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIPPLY3P57055 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIPPLY3P57055 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIPPLY3P57055 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIPPLY3P57055 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIPPLY3P57055 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIPPLY3P57055 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RIPPLY3P57055 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIPPLY3P57055 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIPPLY3P57055 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIPPLY3P57055 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RIPPLY3P57055 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RIPPLY3P57055 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIPPLY3P57055 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIPPLY3P57055 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIPPLY3P57055 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIPPLY3P57055 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIPPLY3P57055 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIPPLY3P57055 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIPPLY3P57055 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIPPLY3P57055 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIPPLY3P57055 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIPPLY3P57055 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIPPLY3P57055 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIPPLY3P57055 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIPPLY3P57055 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIPPLY3P57055 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RIPPLY3P57055 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIPPLY3P57055 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIPPLY3P57055 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIPPLY3P57055 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIPPLY3P57055 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIPPLY3P57055 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIPPLY3P57055 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIPPLY3P57055 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIPPLY3P57055 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIPPLY3P57055 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIPPLY3P57055 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIPPLY3P57055 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIPPLY3P57055 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RIPPLY3P57055 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIPPLY3P57055 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RIPPLY3P57055 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIPPLY3P57055 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIPPLY3P57055 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIPPLY3P57055 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIPPLY3P57055 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIPPLY3P57055 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIPPLY3P57055 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIPPLY3P57055 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIPPLY3P57055 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIPPLY3P57055 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RIPPLY3P57055 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIPPLY3P57055 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIPPLY3P57055 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIPPLY3P57055 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RIPPLY3P57055 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIPPLY3P57055 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIPPLY3P57055 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIPPLY3P57055 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIPPLY3P57055 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIPPLY3P57055 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIPPLY3P57055 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIPPLY3P57055 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIPPLY3P57055 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIPPLY3P57055 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIPPLY3P57055 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIPPLY3P57055 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIPPLY3P57055 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RIPPLY3P57055 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RIPPLY3P57055 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIPPLY3P57055 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIPPLY3P57055 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIPPLY3P57055 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIPPLY3P57055 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIPPLY3P57055 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIPPLY3P57055 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIPPLY3P57055 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RIPPLY3P57055 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RIPPLY3P57055 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RIPPLY3P57055 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RIPPLY3P57055 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RIPPLY3P57055 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RIPPLY3P57055 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RIPPLY3P57055 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RIPPLY3P57055 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms