Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATP12AP54707 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms