Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DAP3P51398 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DAP3P51398 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DAP3P51398 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DAP3P51398 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DAP3P51398 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
DAP3P51398 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
DAP3P51398 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
DAP3P51398 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DAP3P51398 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DAP3P51398 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DAP3P51398 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DAP3P51398 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DAP3P51398 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DAP3P51398 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DAP3P51398 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DAP3P51398 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DAP3P51398 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DAP3P51398 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DAP3P51398 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DAP3P51398 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DAP3P51398 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DAP3P51398 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DAP3P51398 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DAP3P51398 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DAP3P51398 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DAP3P51398 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DAP3P51398 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DAP3P51398 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DAP3P51398 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DAP3P51398 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DAP3P51398 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DAP3P51398 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DAP3P51398 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DAP3P51398 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DAP3P51398 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DAP3P51398 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DAP3P51398 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DAP3P51398 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DAP3P51398 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DAP3P51398 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DAP3P51398 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DAP3P51398 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DAP3P51398 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DAP3P51398 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DAP3P51398 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DAP3P51398 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DAP3P51398 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DAP3P51398 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DAP3P51398 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DAP3P51398 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DAP3P51398 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DAP3P51398 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DAP3P51398 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DAP3P51398 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DAP3P51398 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DAP3P51398 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DAP3P51398 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DAP3P51398 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DAP3P51398 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DAP3P51398 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DAP3P51398 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DAP3P51398 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DAP3P51398 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DAP3P51398 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DAP3P51398 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DAP3P51398 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DAP3P51398 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DAP3P51398 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DAP3P51398 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DAP3P51398 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
DAP3P51398 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
DAP3P51398 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
DAP3P51398 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DAP3P51398 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DAP3P51398 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DAP3P51398 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DAP3P51398 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DAP3P51398 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
DAP3P51398 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DAP3P51398 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DAP3P51398 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DAP3P51398 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DAP3P51398 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DAP3P51398 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DAP3P51398 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DAP3P51398 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DAP3P51398 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DAP3P51398 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DAP3P51398 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DAP3P51398 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DAP3P51398 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DAP3P51398 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DAP3P51398 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DAP3P51398 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DAP3P51398 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DAP3P51398 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DAP3P51398 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DAP3P51398 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DAP3P51398 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms