Protein–RNA interactions for Protein: P51160

PDE6C, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6CP51160 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PDE6CP51160 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PDE6CP51160 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PDE6CP51160 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PDE6CP51160 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PDE6CP51160 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PDE6CP51160 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDE6CP51160 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDE6CP51160 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PDE6CP51160 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDE6CP51160 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PDE6CP51160 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PDE6CP51160 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PDE6CP51160 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDE6CP51160 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms