Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB28P51157 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB28P51157 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB28P51157 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB28P51157 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB28P51157 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB28P51157 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB28P51157 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB28P51157 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB28P51157 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB28P51157 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB28P51157 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB28P51157 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB28P51157 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB28P51157 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB28P51157 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB28P51157 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB28P51157 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB28P51157 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB28P51157 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB28P51157 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB28P51157 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB28P51157 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB28P51157 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB28P51157 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB28P51157 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB28P51157 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB28P51157 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB28P51157 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB28P51157 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB28P51157 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB28P51157 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB28P51157 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB28P51157 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB28P51157 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB28P51157 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB28P51157 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB28P51157 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB28P51157 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB28P51157 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB28P51157 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB28P51157 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB28P51157 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB28P51157 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB28P51157 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB28P51157 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB28P51157 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB28P51157 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB28P51157 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB28P51157 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB28P51157 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB28P51157 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB28P51157 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB28P51157 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB28P51157 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB28P51157 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB28P51157 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB28P51157 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB28P51157 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB28P51157 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB28P51157 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB28P51157 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB28P51157 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB28P51157 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB28P51157 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB28P51157 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB28P51157 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB28P51157 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB28P51157 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB28P51157 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB28P51157 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB28P51157 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB28P51157 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB28P51157 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB28P51157 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB28P51157 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB28P51157 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB28P51157 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB28P51157 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB28P51157 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB28P51157 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB28P51157 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB28P51157 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB28P51157 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB28P51157 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB28P51157 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB28P51157 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB28P51157 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB28P51157 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB28P51157 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB28P51157 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB28P51157 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB28P51157 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB28P51157 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB28P51157 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB28P51157 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB28P51157 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB28P51157 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB28P51157 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB28P51157 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms