Protein–RNA interactions for Protein: P50895

BCAM, Basal cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAMP50895 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BCAMP50895 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BCAMP50895 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BCAMP50895 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BCAMP50895 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BCAMP50895 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BCAMP50895 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
BCAMP50895 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
BCAMP50895 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BCAMP50895 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BCAMP50895 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BCAMP50895 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BCAMP50895 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BCAMP50895 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BCAMP50895 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BCAMP50895 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
BCAMP50895 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BCAMP50895 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BCAMP50895 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
BCAMP50895 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
BCAMP50895 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BCAMP50895 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BCAMP50895 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BCAMP50895 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BCAMP50895 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BCAMP50895 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BCAMP50895 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BCAMP50895 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BCAMP50895 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BCAMP50895 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BCAMP50895 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BCAMP50895 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BCAMP50895 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BCAMP50895 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BCAMP50895 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
BCAMP50895 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
BCAMP50895 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BCAMP50895 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BCAMP50895 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BCAMP50895 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BCAMP50895 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BCAMP50895 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BCAMP50895 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BCAMP50895 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BCAMP50895 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BCAMP50895 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BCAMP50895 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BCAMP50895 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BCAMP50895 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BCAMP50895 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BCAMP50895 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BCAMP50895 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BCAMP50895 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
BCAMP50895 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BCAMP50895 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BCAMP50895 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BCAMP50895 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BCAMP50895 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BCAMP50895 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
BCAMP50895 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BCAMP50895 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BCAMP50895 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BCAMP50895 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BCAMP50895 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BCAMP50895 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BCAMP50895 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BCAMP50895 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
BCAMP50895 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
BCAMP50895 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BCAMP50895 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BCAMP50895 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BCAMP50895 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BCAMP50895 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BCAMP50895 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
BCAMP50895 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BCAMP50895 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BCAMP50895 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BCAMP50895 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BCAMP50895 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BCAMP50895 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BCAMP50895 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BCAMP50895 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BCAMP50895 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BCAMP50895 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BCAMP50895 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BCAMP50895 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BCAMP50895 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
BCAMP50895 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BCAMP50895 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BCAMP50895 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BCAMP50895 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BCAMP50895 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BCAMP50895 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
BCAMP50895 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
BCAMP50895 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BCAMP50895 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BCAMP50895 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BCAMP50895 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BCAMP50895 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BCAMP50895 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms