Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF6P49848 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF6P49848 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF6P49848 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF6P49848 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF6P49848 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF6P49848 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF6P49848 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF6P49848 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF6P49848 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF6P49848 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF6P49848 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF6P49848 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF6P49848 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF6P49848 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF6P49848 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF6P49848 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TAF6P49848 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TAF6P49848 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TAF6P49848 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TAF6P49848 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TAF6P49848 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TAF6P49848 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TAF6P49848 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TAF6P49848 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TAF6P49848 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TAF6P49848 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TAF6P49848 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TAF6P49848 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TAF6P49848 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TAF6P49848 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TAF6P49848 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TAF6P49848 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TAF6P49848 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TAF6P49848 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TAF6P49848 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TAF6P49848 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TAF6P49848 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TAF6P49848 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TAF6P49848 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TAF6P49848 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TAF6P49848 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF6P49848 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF6P49848 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF6P49848 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF6P49848 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF6P49848 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF6P49848 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF6P49848 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF6P49848 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF6P49848 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF6P49848 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF6P49848 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF6P49848 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF6P49848 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF6P49848 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF6P49848 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF6P49848 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF6P49848 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF6P49848 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF6P49848 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF6P49848 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF6P49848 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF6P49848 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF6P49848 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF6P49848 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TAF6P49848 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
TAF6P49848 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TAF6P49848 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TAF6P49848 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TAF6P49848 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TAF6P49848 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TAF6P49848 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TAF6P49848 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TAF6P49848 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TAF6P49848 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TAF6P49848 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TAF6P49848 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TAF6P49848 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TAF6P49848 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TAF6P49848 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TAF6P49848 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TAF6P49848 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TAF6P49848 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TAF6P49848 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TAF6P49848 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TAF6P49848 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TAF6P49848 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TAF6P49848 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TAF6P49848 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TAF6P49848 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TAF6P49848 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TAF6P49848 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TAF6P49848 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TAF6P49848 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TAF6P49848 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF6P49848 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF6P49848 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF6P49848 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF6P49848 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms